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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
황소윤 (가천대학교) 황유현 (가천대학교) 오민 (가천대학교) 윤영미 (가천대학교)
저널정보
한국정보기술학회 한국정보기술학회논문지 한국정보기술학회논문지 제14권 제9호(JKIIT, Vol.14, No.9)
발행연도
2016.9
수록면
119 - 129 (11page)
DOI
10.14801/jkiit.2016.14.9.119

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2019

신약재창출을 위한 질병 관련 약물 작용경로 예측모델
황소윤 IT융합공학과 2019.01 학위논문

2016

약물-질병 경로 네트워크의 구축과 비교를 통한 신약재창출
황소윤 ,  황유현 ,  오민 외 1명 한국정보기술학회논문지 2016.09 학술저널

초록· 키워드

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유전체 데이터가 지속적으로 증가함에 따라, 이를 사용하여 약물 작용 메커니즘을 밝히려는 다양한 연구가 진행되어왔다. 그러나 기존 연구들에도 불구하고 약물 작용 메커니즘은 아직 완벽하게 밝혀지지 않았다. 따라서, 본 연구에서는 약물 작용 메커니즘을 더 잘 이해하기 위하여 단백질 간의 상호작용 네트워크를 기반으로 약물-질병 유전자 네트워크를 구축하였으며, 이를 신약재창출에 적용하였다. 약물-질병 목록에 대해 경로 네트워크를 구축하기 위하여, 약물 표적 유전자에서부터 약물 관련 유전자를 경유하여 질병 관련 유전자에 도달하는 최단 경로 네트워크를 구축하였다. 약물-질병 목록들 중 치료 관계에 속하는 약물-질병 목록에 대하여 주요 유전자 네트워크를 추출하였다. 주요 유전자 네트워크와 치료 관계가 아닌 약물들에 대하여 구축한 후보 네트워크 사이의 유사도를 측정하여, 측정 결과 값에 따라 새로운 약물 적응증들을 예측하였다. 피셔의 정확성 검정을 통하여 예측한 약물 적응증들이 CTD 데이터베이스에서 수집한 치료 관계의 약물-질병 목록에 유의하게 포함되어 있음을 확인하였다 (Fisher"s exact P = 7.01E-104). 또한, 실험이 정확도를 평가하기 위하여 ROC 곡선의 AUC 값을 측정하였으며, 측정값은 0.7122로 확인되었다.
#mechanism of drug action #protein-protein interaction network #drug repositioning #data mining #bioinformatics

목차

요약
Abstract
Ⅰ. 서론
Ⅱ. 관련 연구
Ⅲ. 연구 방법
Ⅳ. 실험 데이터
Ⅴ. 실험 결과
Ⅵ. 결론
References

참고문헌 (18)

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[학술지(정기간행물)] - Iskar, Murat / 2012 / Drug discovery in the age of systems biology : the rise of computational approaches for data integration / Current opinion in biotechnology 23 (4) : 609 ~ 616 google schola [학술지(정기간행물)] - Kotlyar, Max / 2012 / Network-based characterization of drug-regulated genes, drug targets, and toxicity / Methods 57 (4) : 499 ~ 507 google schola [학술지(정기간행물)] - Zhao, Shiwen / 2010 / Network-based relating pharmacological and genomic spaces for drug target identification / PloS one 5 (7) : e11764 ~ google schola [학술지(정기간행물)] - Liu, Ke-Qin / 2012 / Identifying dysregulated pathways in cancers from pathway interaction networks / BMC bioinformatics 13 (1) : 1 ~ google schola [학술지(정기간행물)] - Gottlieb A / 2014 / Integrating systems biology sources illuminates drug action / Clin Pharmacol Ther 95 (6) : 663 ~ 669 google schola

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