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카로티노이드 생산 균주를 탐색하기 위하여 나팔꽃에서 분리한 노란색 색소를 생산하는 NP2-R2 균주를 선발하였다. 16S rRNA 염기서열 분석 결과, NP2-R2 균주는 Sphingomonas sanguinis에 가장 높은 유사도(99.86%)를 나타내었다. NP2-R2 균주의 총 염기서열은 4,372,860 bp이고 G + C content가 66.06%이었다. 유전체에서 단백질 유전자 3,920개, tRNA 유전자 65개, rRNA 유전자 12개를 확인하였다. 또한 카로티노이드 생합성과 관련된 유전자 crtB, crtI, crtY를 포함하고 있는 것을 확인하였다. 본 유전체 염기서열은 비교유전체 연구와 카로티노이드 생합성의 대사공학을 위한 유용한 정보를 제공할 것이다.
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An H, Xu M, Dai J, Wang Y, Cai F, Qi H, Peng F, and Fang C. 2011. Sphingomonas xinjiangensis sp. nov., isolated from desert sand. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61, 1865–1869.
Cha I, Kang H, Kim H, and Joh K. 2019. Sphingomonas ginkgonis sp. nov., isolated from phyllosphere of Ginkgo biloba. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 69, 3224–3229.
Cheng L, Swofford CA, and Sinskey AJ. 2020. Modular engineering for microbial production of carotenoids. Metab. Eng. Commun. 10, e00118.
Kim SJ, Moon JY, Lim JM, Ahn JH, Weon HY, Ahn TY, and Kwon SW. 2014. Sphingomonas aerophila sp. nov. and Sphingomonas naasensis sp. nov., isolated from air and soil, respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 64, 926–932.
Kumar S, Stecher G, and Tamura K. 2016. MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol. 33, 1870–1874.
Cha I, Kang H, Kim H, and Joh K. 2019. Sphingomonas ginkgonis sp. nov., isolated from phyllosphere of Ginkgo biloba. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 69, 3224–3229.
Cheng L, Swofford CA, and Sinskey AJ. 2020. Modular engineering for microbial production of carotenoids. Metab. Eng. Commun. 10, e00118.
Kim SJ, Moon JY, Lim JM, Ahn JH, Weon HY, Ahn TY, and Kwon SW. 2014. Sphingomonas aerophila sp. nov. and Sphingomonas naasensis sp. nov., isolated from air and soil, respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 64, 926–932.
Kumar S, Stecher G, and Tamura K. 2016. MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol. 33, 1870–1874.
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